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大咖講堂 | 解鎖腫瘤單細胞轉錄組數據分析

時間:2020年03月27日地點:線上會議講座


清華大學古槿副教授

近年來致力于研究腫瘤組學大數據信息處理的理論與方法,在組學數據低維特征學習、腫瘤細胞狀態的精準識別與命運調控等方面取得了若干成果。成果發表于 Nucleic Acids Research、Bioinformatics、Briefings in Bioinformatics、Gastroenterology 等國際頂級期刊,獲得國家自然科學基金優秀青年科學基金資助。

報告摘要:

"腫瘤異質性是腫瘤診療面臨的重大挑戰。近年來單細胞組學技術的發展使得從單細胞層面解讀腫瘤異質性成為可能。結合國際最新進展與課題組的研究成果,以肝癌、胰腺癌、白血病等為例,探討如何在單細胞水平研究腫瘤細胞以及腫瘤微環境的異質性、如何整合單細胞組學與傳統組學信息。介紹課題組最新開發的腫瘤單細胞轉錄組分析軟件 scCancer,助力腫瘤異質性研究。

 清華大學郭文博博士生

主要研究腫瘤領域單細胞測序數據分析。

報告摘要:

單細胞測序技術的發展極大地促進了腫瘤異質性的研究。本次分享,將介紹古槿老師課題組最新開發的腫瘤單細胞轉錄組分析軟件 scCancer。該軟件在整合了單細胞轉錄組數據常規分析(如聚類、差異表達分析等)的基礎上,還考慮了更多腫瘤樣本的特點,加入了以下腫瘤相關的分析:更全面的質控、腫瘤微環境主要細胞類型辨識、細胞惡性估計、腫瘤內部異質性分析、細胞交互分析、多樣本整合分析等。所有分析均以用戶友好的方式進行執行與展示。

 伯豪生物程小濤產品經理

遺傳學碩士,在校期間主要從事基因組學和分子遺傳學研究。參與多項國家“863”計劃項目和自然科學基金項目;擁有高通量行業 8 年生信分析實戰經驗,累計協助完成 400 余例科研項目的設計、數據分析,培訓學員上百。目前在上海伯豪生物技術有限公司擔任單細胞項目負責人,對高通量基因組學技術的應用及數據分析,尤其是 lncRNA、circRNA 等非編碼 RNA 的研究,以及單細胞水平的測序技術有豐富的經驗。

報告摘要:

暫時保密,靜待課程精彩呈現!


課程安排:

3 月 27 日(10:00 直播開始)
10:00~10:1510:15~10:4010:40~11:0011:00~11:10
腫瘤單細胞與空間轉錄組  主要研究腫瘤領域單細胞測序數據的分析  單細胞測序技術項目經驗分享  提問及討論
古槿 副教授 清華大學郭文博 博士生 清華大學程小濤 產品經理 伯豪生物


報名參與方式:



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